MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 67217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021829	AAT	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021829	ACA	2	6	21	26	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021829	ATA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021829	CAT	2	6	62	67	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021829	TTA	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021829	CCA	2	6	88	93	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021829	TAGT	2	8	124	131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021829	CAT	2	6	166	171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021829	AAT	2	6	248	253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021829	T	9	9	275	283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021829	ACAA	2	8	292	299	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021829	TAA	2	6	320	325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021829	CAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723660
14	NC_021829	A	6	6	361	366	100 %	0 %	0 %	0 %	525723660
15	NC_021829	ATTT	2	8	434	441	25 %	75 %	0 %	0 %	525723660
16	NC_021829	TAAA	2	8	455	462	75 %	25 %	0 %	0 %	525723660
17	NC_021829	TCAT	2	8	463	470	25 %	50 %	0 %	25 %	525723660
18	NC_021829	TA	3	6	471	476	50 %	50 %	0 %	0 %	525723660
19	NC_021829	A	6	6	487	492	100 %	0 %	0 %	0 %	525723660
20	NC_021829	ATAA	2	8	562	569	75 %	25 %	0 %	0 %	525723660
21	NC_021829	TAA	2	6	608	613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723660
22	NC_021829	AGCA	2	8	618	625	50 %	0 %	25 %	25 %	525723660
23	NC_021829	ACAT	2	8	777	784	50 %	25 %	0 %	25 %	525723660
24	NC_021829	ATT	2	6	793	798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723660
25	NC_021829	A	6	6	919	924	100 %	0 %	0 %	0 %	525723660
26	NC_021829	AAG	2	6	971	976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723660
27	NC_021829	CAT	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723660
28	NC_021829	ATA	2	6	1007	1012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723660
29	NC_021829	ATAA	2	8	1064	1071	75 %	25 %	0 %	0 %	525723660
30	NC_021829	CCT	2	6	1087	1092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723661
31	NC_021829	TA	4	8	1138	1145	50 %	50 %	0 %	0 %	525723661
32	NC_021829	TGT	2	6	1159	1164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723661
33	NC_021829	T	8	8	1173	1180	0 %	100 %	0 %	0 %	525723661
34	NC_021829	ATCT	2	8	1283	1290	25 %	50 %	0 %	25 %	525723661
35	NC_021829	TAA	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723661
36	NC_021829	AAT	2	6	1324	1329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723661
37	NC_021829	A	6	6	1366	1371	100 %	0 %	0 %	0 %	525723661
38	NC_021829	GAA	2	6	1387	1392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723661
39	NC_021829	T	6	6	1465	1470	0 %	100 %	0 %	0 %	525723661
40	NC_021829	TCA	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
41	NC_021829	TCT	2	6	1498	1503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723661
42	NC_021829	TAATC	2	10	1506	1515	40 %	40 %	0 %	20 %	525723661
43	NC_021829	TCA	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
44	NC_021829	AT	3	6	1536	1541	50 %	50 %	0 %	0 %	525723661
45	NC_021829	GTT	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723661
46	NC_021829	CCA	2	6	1593	1598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525723661
47	NC_021829	T	6	6	1617	1622	0 %	100 %	0 %	0 %	525723661
48	NC_021829	CT	4	8	1660	1667	0 %	50 %	0 %	50 %	525723661
49	NC_021829	T	6	6	1667	1672	0 %	100 %	0 %	0 %	525723661
50	NC_021829	TCA	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
51	NC_021829	T	8	8	1761	1768	0 %	100 %	0 %	0 %	525723661
52	NC_021829	AGA	2	6	1790	1795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723661
53	NC_021829	CTT	2	6	1888	1893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723661
54	NC_021829	TAT	2	6	1915	1920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723661
55	NC_021829	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723661
56	NC_021829	ATGCAC	2	12	1964	1975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021829	GCA	2	6	2041	2046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021829	GAT	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021829	CATGTA	2	12	2056	2067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021829	ATT	2	6	2136	2141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021829	TGA	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021829	ATTC	2	8	2172	2179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021829	CCT	2	6	2185	2190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021829	T	6	6	2196	2201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021829	ATAA	2	8	2266	2273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021829	T	6	6	2304	2309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021829	ATT	2	6	2311	2316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021829	AT	3	6	2325	2330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021829	ATA	2	6	2342	2347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021829	TA	3	6	2377	2382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021829	ATA	2	6	2422	2427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021829	A	6	6	2427	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021829	A	6	6	2450	2455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021829	AAT	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021829	T	6	6	2491	2496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021829	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021829	A	7	7	2559	2565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021829	A	9	9	2590	2598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021829	AAT	2	6	2615	2620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021829	A	6	6	2653	2658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021829	CGA	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021829	CGT	2	6	2675	2680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021829	TCA	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021829	TTA	2	6	2751	2756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723662
85	NC_021829	GTTA	2	8	2816	2823	25 %	50 %	25 %	0 %	525723662
86	NC_021829	T	6	6	2905	2910	0 %	100 %	0 %	0 %	525723662
87	NC_021829	TCA	2	6	2979	2984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723662
88	NC_021829	TCC	2	6	3081	3086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021829	ATT	2	6	3103	3108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021829	AGG	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021829	ATT	2	6	3205	3210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021829	AAT	2	6	3212	3217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021829	A	7	7	3225	3231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021829	CAT	2	6	3247	3252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021829	TTA	2	6	3348	3353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021829	GAT	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021829	ATT	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021829	ATA	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
99	NC_021829	A	6	6	3618	3623	100 %	0 %	0 %	0 %	525723663
100	NC_021829	ATC	2	6	3641	3646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723663
101	NC_021829	GAT	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723663
102	NC_021829	TCT	2	6	3672	3677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
103	NC_021829	ATT	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
104	NC_021829	ATC	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723663
105	NC_021829	TTA	2	6	3723	3728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
106	NC_021829	TGT	2	6	3739	3744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723663
107	NC_021829	ATCT	2	8	3799	3806	25 %	50 %	0 %	25 %	525723663
108	NC_021829	ATT	3	9	3884	3892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
109	NC_021829	ATA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
110	NC_021829	TTA	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
111	NC_021829	AAT	2	6	3985	3990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
112	NC_021829	CTT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
113	NC_021829	TGT	2	6	4017	4022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723663
114	NC_021829	TTATT	2	10	4024	4033	20 %	80 %	0 %	0 %	525723663
115	NC_021829	TTA	2	6	4071	4076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
116	NC_021829	TCC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723663
117	NC_021829	TCT	2	6	4092	4097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
118	NC_021829	T	7	7	4133	4139	0 %	100 %	0 %	0 %	525723663
119	NC_021829	GAT	2	6	4144	4149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723663
120	NC_021829	CAA	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723663
121	NC_021829	ATGC	2	8	4214	4221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021829	TTA	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021829	TAT	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021829	GCTA	2	8	4258	4265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021829	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021829	CAT	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021829	CTT	2	6	4325	4330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723664
128	NC_021829	CT	3	6	4338	4343	0 %	50 %	0 %	50 %	525723664
129	NC_021829	ATT	2	6	4399	4404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723664
130	NC_021829	TTC	2	6	4419	4424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723664
131	NC_021829	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723664
132	NC_021829	T	6	6	4457	4462	0 %	100 %	0 %	0 %	525723664
133	NC_021829	CAT	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723664
134	NC_021829	TAG	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723665
135	NC_021829	TAT	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723665
136	NC_021829	TTA	2	6	4627	4632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723665
137	NC_021829	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723665
138	NC_021829	AAC	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723665
139	NC_021829	T	6	6	4783	4788	0 %	100 %	0 %	0 %	525723665
140	NC_021829	TGT	2	6	4928	4933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723666
141	NC_021829	AGTT	2	8	4943	4950	25 %	50 %	25 %	0 %	525723666
142	NC_021829	TTC	2	6	4952	4957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723666
143	NC_021829	TTC	2	6	4998	5003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723666
144	NC_021829	CCTC	2	8	5031	5038	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_021829	AAT	2	6	5057	5062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021829	GGT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_021829	T	6	6	5454	5459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021829	T	6	6	5475	5480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021829	TAT	2	6	5509	5514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_021829	CT	3	6	9901	9906	0 %	50 %	0 %	50 %	525723670
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272	NC_021829	CCT	2	6	10139	10144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723670
273	NC_021829	AT	3	6	10244	10249	50 %	50 %	0 %	0 %	525723670
274	NC_021829	T	7	7	10269	10275	0 %	100 %	0 %	0 %	525723670
275	NC_021829	CAT	2	6	10311	10316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723671
276	NC_021829	CTC	2	6	10317	10322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723671
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278	NC_021829	TAT	2	6	10352	10357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723671
279	NC_021829	TTTA	2	8	10401	10408	25 %	75 %	0 %	0 %	525723671
280	NC_021829	T	6	6	10422	10427	0 %	100 %	0 %	0 %	525723671
281	NC_021829	TCA	2	6	10432	10437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723671
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283	NC_021829	TCTT	2	8	10472	10479	0 %	75 %	0 %	25 %	525723671
284	NC_021829	CTT	2	6	10508	10513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723671
285	NC_021829	TCATTT	2	12	10514	10525	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525723671
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287	NC_021829	TTC	2	6	10539	10544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723671
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289	NC_021829	AATTT	2	10	10613	10622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021829	CAA	2	6	10650	10655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_021829	ATA	2	6	10756	10761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_021829	TATTT	2	10	11042	11051	20 %	80 %	0 %	0 %	525723672
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346	NC_021829	AAC	2	6	13381	13386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721268
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408	NC_021829	TTC	2	6	16448	16453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721271
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412	NC_021829	TCT	2	6	16688	16693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721272
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442	NC_021829	TCT	2	6	18017	18022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_021829	TTA	2	6	18049	18054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_021829	ATA	3	9	18062	18070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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